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閱讀指導(dǎo)

閱讀指導(dǎo)

施一公:如何閱讀英文文獻(xiàn)?

2020.09.17 0+

從小到大,我感性思維多一些,不善于讀書。85至89年在清華生物系讀本科期間,從未讀過任何一種英文專業(yè)期刊。我受到的與英文閱讀相關(guān)的訓(xùn)練一共只有兩個。

一是我在1986年暑假期間選修的時任系主任的蒲慕明老師開設(shè)的《生物英語》系列講座,隱隱約約記得蒲先生讓我們閱讀一些諸如DNA雙螺旋發(fā)現(xiàn)之類的科普性英文文章,很有意思。但時間較短,暑假過后也沒有養(yǎng)成讀英文文章的習(xí)慣。

二是《生物化學(xué)》這門課。與現(xiàn)在的清華生命學(xué)院形成鮮明對比,我上大學(xué)期間的所有基礎(chǔ)課和專業(yè)課都是采用中文教材、中文講課,只有鄭昌學(xué)老師講授的《生物化學(xué)》采用了Lehninger的《Principles of Biochemistry》,而且鄭老師要求我們每個學(xué)生每次課后閱讀10-20頁教材。我們同學(xué)大多感覺到專業(yè)英文閱讀有所提高。

1990年4月至7月初,我在依阿華州Ames小鎮(zhèn)的Iowa State University度過了初到美國的前三個月,其中大部分時間在Herbert Fromm教授的實(shí)驗室做輪轉(zhuǎn)(rotation),跟隨劉峰和董群夫妻兩人做研究(劉峰現(xiàn)在University of Texas Health Science Center做教授)。當(dāng)時感覺最困難的就是讀專業(yè)論文。有一次,F(xiàn)romm教授要求我在組會上講解一篇《Journal of Biological Chemistry》的文章,我提前兩天開始閱讀,第一遍花了足足六個小時,許多生詞只能依靠英漢詞典,文章中的有些關(guān)鍵內(nèi)容還沒有完全讀懂,當(dāng)時的感覺是JBC的文章怎么這么長、這么難懂?!真有點(diǎn)苦不堪言。為了能給Fromm教授和師兄師姐留下好印象,第二天又花了好幾個小時讀第二遍,還做了總結(jié)。第三天我在組會上的表現(xiàn)總算沒有給清華丟臉。但是,前前后后,真搞不清楚自己為了這一篇文章到底花了多少時間!

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90年7月我轉(zhuǎn)學(xué)到約翰霍普金斯大學(xué)以后,與本科來自北大的虞一華同在IPMB program。虞一華大我一歲,來巴爾地摩之前已經(jīng)在夏威夷大學(xué)讀了一年的研究生,對于科研論文的閱讀比我強(qiáng)多了。他常常在IPMB的辦公室里拿著《科學(xué)》和《自然》周刊津津有味地閱讀,看得我很眼饞,也不理解其中那些枯燥的文章有什么意思。他告訴我:他在讀很有意思的科學(xué)新聞??茖W(xué)新聞能有什么意思?虞一華給我講了好幾個故事:洛克菲勒大學(xué)校長諾貝爾獎得主David Baltimore如何深陷泥潭、人類基因組測序如何爭辯激烈、HIV病毒究竟是誰發(fā)現(xiàn)的,等等。

我還真沒有想到學(xué)術(shù)期刊上會有這么多我也應(yīng)該看得懂的內(nèi)容!從那時起,每一期新的《科學(xué)》和《自然》一到,我也開始嘗試著閱讀里面的新聞和研究進(jìn)展介紹,這些內(nèi)容往往出現(xiàn)在“News & Comment”“Research News”“News & Views”“Perspectives”等欄目,文筆平實(shí),相對于專業(yè)的科研論文很容易讀懂。有時,我還把讀到的科研新聞講給我的同事朋友們聽,而同事的提問和互動對我又是更好的鼓勵。除了《科學(xué)》和《自然》,我也常常翻看《科學(xué)美國人》(“Scientific American”)。

與《細(xì)胞》(Cell)、《生物化學(xué)期刊》(JBC)等非常專業(yè)的期刊不同,《科學(xué)》和《自然》里面有相當(dāng)一部分內(nèi)容是用來做科普教育的。《科學(xué)》周刊的“Perspectives”和《自然》周刊的“News & Views”欄目都是對重要科學(xué)論文的深入淺出的介紹,一般1-3頁,讀起來比較通俗易懂,較易入門。讀完這些文章后,再讀原始的科學(xué)論文,感覺好多了!而且可以把自己的體會與專家的分析比較一下,找找差距,有時甚至也能找回來一點(diǎn)自信!

從1998年在普林斯頓大學(xué)任職到現(xiàn)在清華大學(xué)做教授,我總是告訴自己實(shí)驗室的所有年輕人(包括本科生、碩士生、博士生、博士后)下面這幾點(diǎn)讀科研論文的體會,也希望我的學(xué)生跟我學(xué):

1.請每位學(xué)生每周關(guān)注《科學(xué)》和《自然》。(生命科學(xué)界的學(xué)生還應(yīng)該留心《細(xì)胞》)。如果時間有限,每周花一個小時讀讀這兩種周刊里的文章標(biāo)題以及與自己研究領(lǐng)域相關(guān)的科研論文的abstract,即可!這樣做可以保證一個學(xué)生基本上能夠跟蹤本領(lǐng)域最重要的發(fā)現(xiàn)和進(jìn)展,同時開闊視野,大概知道其它領(lǐng)域的動態(tài)。

2.在時間充足的情況下,可以細(xì)讀《科學(xué)》和《自然》里的新聞及科研論文。如果該科研論文有“News & Views”或“Perspectives”來介紹,請先讀這些文章,這類導(dǎo)讀的文章會提煉問題,就好比是老師事先給學(xué)生講解一番論文的來龍去脈,對學(xué)生閱讀原始論文有很大幫助。

3.在讀具體的科研論文時,最重要的是了解文章的主線邏輯。文章中的所有Figures都是按照這個主線邏輯展開描述的。所以,我一般先讀“introduction”部分,然后很快地看一遍Figures。大概知道這條主線之后,才一字一句地去讀“results”和“discussion”。

4.當(dāng)遇到一些實(shí)驗或結(jié)果分析很晦澀難懂時,不必花太多時間深究,而力求一氣把文章讀完。也許你的問題在后面的內(nèi)容中自然就有解答。這與聽學(xué)術(shù)講座非常相似!你如果想每個細(xì)節(jié)都聽懂,留心每一個技術(shù)細(xì)節(jié),那你聽學(xué)術(shù)講座不僅會很累,而且也許會為了深究一個小技術(shù)環(huán)節(jié)而影響了對整個講座邏輯推理及核心結(jié)論的理解。

5.對個別重要的文章和自己領(lǐng)域內(nèi)的科研論文,應(yīng)該精讀。對與自己課題相關(guān)的每一篇論文則必須字斟句酌地讀。這些論文,不僅要完全讀懂,理解每一個實(shí)驗的細(xì)節(jié)、分析、結(jié)論,還必須聯(lián)想到這些實(shí)驗和結(jié)論對自己的課題的影響和啟發(fā),提出自己的觀點(diǎn)。

6.科學(xué)論文的閱讀水平是循序漸進(jìn)的。每個人開始都會很吃力,所以你有這種感覺不要?dú)怵H。堅持很重要,你一定會漸入佳境。當(dāng)你有問題時或有絕妙分析時,應(yīng)該與師兄師姐或找導(dǎo)師討論。

7.科研訓(xùn)練的一個重要組成部分就是科研論文的閱讀。每一個博士生必須經(jīng)過嚴(yán)格的科研論文閱讀的訓(xùn)練。除了你自己的習(xí)慣性閱讀外,你應(yīng)該在研究生階段選修以閱讀分析專業(yè)文獻(xiàn)為主的一至兩門課,在實(shí)驗室內(nèi)也要有定期的科研論文討論(Journal Club)。如果你的實(shí)驗室還沒有這種討論,你們學(xué)生可以自發(fā)地組織起來。

8.前面幾條都是討論如何提高科研論文的閱讀能力,但是一旦入了門,就要學(xué)會critical reading。不要迷信已發(fā)表的論文,哪怕是發(fā)表在非常好的期刊上。要時刻提醒自己:該論文邏輯是否嚴(yán)謹(jǐn),數(shù)據(jù)是否可靠,實(shí)驗證據(jù)是否支持結(jié)論,你是否能想出更好的實(shí)驗,你是否可以在此論文的基礎(chǔ)上提出新的重要問題?等等。

天外有天,讀科研論文是一件很簡單、但也很深奧的事情。一般的學(xué)生常常滿足于讀懂、讀透一篇好的論文,優(yōu)秀的學(xué)生則會舉一反三、通過查找references縱深了解整個領(lǐng)域的歷史、現(xiàn)狀,并展望該領(lǐng)域未來的可能進(jìn)展。

我從1990年對學(xué)術(shù)論文一竅不通到96年博士后期間的得心應(yīng)手,還常常幫助同事分析,自以為水平了得。但是有一件事讓我看到了自己的嚴(yán)重不足,頗為羞愧。

1996年,是SMAD蛋白發(fā)現(xiàn)及TGF-b信號轉(zhuǎn)導(dǎo)研究的最激動人心的一年,哈佛醫(yī)學(xué)院的Whitman實(shí)驗室在十月份的《自然》雜志上以“Article”的形式發(fā)表了一篇名為“A transcriptional partner for MAD proteins in TGF-b signaling”的文章。

讀完之后,正好遇到TGF-b領(lǐng)域的著名學(xué)者Joan Massague,我對Joan評論說:I’m not so sure why this paper deserves a full article in Nature. They just identified another Smad-interacting protein, and the data quality is mediocre.

完全出乎我的意料,Joan馬上回應(yīng)我:I disagree! This paper links the cytoplasmic Smad protein into the nucleus and identifies a transcription factor as its interacting protein. Now the TGF-b signaling pathway is complete. It is a beautiful Nature article!

這件事對我觸動極大:原來大師的視野和品位遠(yuǎn)遠(yuǎn)在我之上。從那以后,我也開始從整個領(lǐng)域的發(fā)展方面來權(quán)衡一篇文章的重要性,這件事對我今后為國際重要學(xué)術(shù)期刊審稿、自己實(shí)驗室選擇研究課題都起到了相當(dāng)重要的作用。

如今,我閱讀一篇本領(lǐng)域內(nèi)的科研論文,非常順利,而且常??梢钥闯鲆恍┳髡邲]有想到或分析到的關(guān)鍵點(diǎn)?;叵霃那?,感慨萬千,感謝蒲慕明、鄭昌學(xué)、虞一華、John Desjarlais、Jeremy Berg、Joan Massague等一批老師和同事對我的幫助。我很留心,也很用心。